Amoni bifluoride, như tên gọi của nó, chứa một amoni (NH4+) và bifluoride, hoặc hydro (Difluoride), anion (HF2−). Các anion bifluoride triatom đối xứng trung tâm có liên kết hydro mạnh nhất được biết đến, với chiều dài F − H là 114 pm. và năng lượng liên kết lớn hơn 155 kJ mol − 1.

Trong chất rắn [NH4] [HF2], mỗi cation amoni được bao quanh bởi bốn trung tâm fluoride trong một khối tứ diện, với các liên kết hydro hydro-flo có mặt giữa các các nguyên tử hydro của ion amoni và các nguyên tử flo. Các giải pháp chứa các cation tứ diện [NH4]+ và anion [HF2].